Home
FAIR-data in de toxicologie verbeteren: ELIXIR-NL draagt bij aan essentiële workshops
Egon Willighagen (Universiteit Maastricht) en Rob Stierum (TNO) zijn de co-leiders van het INTOXICOM (Integrating the Toxicology Community into ELIXIR) project. Het voornaamste doel van dit 2-jarige project is het faciliteren van de integratie van internationale standaarden, tools en middelen om toxicologisch onderzoek en risicobeheer op zowel nationaal als internationaal niveau te verbeteren.
Health-RI richt zich op het hergebruiken van gezondheidsdata en het bieden van data-infrastructuren ter ondersteuning van onderzoek, innovatie en beleid. Health-RI is de host van ELIXIR-NL, de Nederlandse Node van ELIXIR, een Europese onderzoeksinfrastructuur voor biowetenschappen, die een sleutelrol speelt in het waarborgen dat toxicologische onderzoeksdata goed georganiseerd, toegankelijk en herbruikbaar zijn. ELIXIR-NL werkt actief samen met andere landen (“nodes”) om toxicologische data FAIR te maken - zodat de data vindbaar, toegankelijk, interoperabel en herbruikbaar (FAIR) zijn, en organiseert een workshopreeks die open staat voor toxicologen, bioinformatici of datamanagers die werken in de computationele toxicologie.
Egon Willighagen (Universiteit Maastricht) en Rob Stierum (TNO) zijn de co-leiders van het INTOXICOM (Integrating the Toxicology Community into ELIXIR) project. Het voornaamste doel van dit 2-jarige project is het faciliteren van de integratie van internationale standaarden, tools en middelen om toxicologisch onderzoek en risicobeheer op zowel nationaal als internationaal niveau te verbeteren. Bij dit 2-jarige project werken 6 nationale ELIXIR-knooppunten samen en het wordt gefinancierd door ELIXIR Europa. ELIXIR-NL ondersteunt onderzoekers actief bij het FAIR maken van toxicologische data. In dit kader zijn er recent twee workshops georganiseerd om toxicologisch datamanagement en internationale samenwerking te versterken. Deze workshops versterken de nationale en internationale samenwerking en ondersteunen de FAIRificatie van toxicologische data, wat zorgt voor een grotere toegankelijkheid, hergebruik en interoperabiliteit tussen onderzoeksprojecten.
FAIRification of Toxicological Research Output
De eerste workshop, FAIRification of Toxicological Research Output, werd gehouden op het Health-RI kantoor in Utrecht, Nederland. Er werd onderzocht hoe de data- and interoperabiliteitsplatforms van ELIXIR het beheer van toxicologische data kunnen verbeteren, waarbij de belangrijkste uitdagingen van onderzoeksconsortia zoals PARC, ASPIS en het NanoSafety Cluster; VHP4safety werden aangekaart. De deelnemers bespraken manieren om de toegankelijkheid van gegevens te verbeteren en om deze in lijn te brengen met de FAIR-principes.
Enhancing Research Output: FAIR documentation and Tool Management for toxicology studies
De tweede workshop, Enhancing Research Output: FAIR documentation and Tool Management for toxicology studies, vond plaats aan de universiteit van Basel, Zwitserland (zie foto). Deze 'hands-on'-sessie heeft onderzoekers wegwijs gemaakt in het gebruik van ELIXIR-hulpmiddelen om de toxicologische onderzoeksresultaten te verbeteren. Niet alleen je onderzoeksgegevens en toxicologische modellen FAIR maken, maar ook investeren in FAIR-trainingsmateriaal was een van de belangrijkste boodschappen. Trainingsmaterialen zijn onderzoeksresultaten en moeten vindbaar-toegankelijk-interoperabel herbruikbaar zijn. Deelnemers gingen aan de slag met modelsjablonen voor EOSC, bio.tools en voorspellende toxicologieoplossingen, waarbij de nadruk lag op metadata-annotatie en standaardisatie binnen toxicologisch onderzoek. Door middel van praktische oefeningen en inzichten van experts bood de workshop uitvoerbare stappen voor onderzoekers om hun data, modellen en tools en trainingsmaterialen te FAIRificeren.
Workshop over Toxicologische Tools in Uppsala
Een derde workshop over “Toxicologische tools toegankelijker en interoperabeler maken” is gepland op 26 en 27 maart in Uppsala, Zweden. Toxicologen, bioinformatici of datamanagers werkzaam in de computationele toxicologie en daarbuiten die meer willen weten over computationele toxicologie en de toepassingsmogelijkheden kunnen zich hier inschrijven. Deelname is gratis!
We willen alle deelnemers, sprekers en bijdragers bedanken voor hun waardevolle bijdrage om deze workshops tot een succes te maken en kijken uit naar het vervolg van deze belangrijke workshopreeks.
Meer informatie | Schrijf je in voor toekomstige workshops
